Антибактериальная терапия может стать не только малоэффективной, но и небезопасной.  В Массачусетском технологическом институте и в Университете Калифорнии специалисты решили, что антибактериальная терапия должна назначаться пациентам, заразившимся инфекцией, реже, чем обычно. Дело в том, что антибиотики способны оказывать существенное влияние на состав химических соединений, выделяемых телом. 

Такая особенность благоприятна для защиты бактерий, поддержания их жизнедеятельности и размножения. Антибактериальные препараты могут подавлять способность иммунных клеток противостоять инородным бактериям.

Во время проведенного экспериментального исследования лабораторные грызуны были намеренно инфицированы кишечной палочкой Escherichia coli. Животным были даны антибактериальные препараты. 

Выяснилось, что в очаге активности инфекции у грызунов  после приема антибиотиков существенно повысился уровень концентрации метаболитов. К такому заключению пришли специалисты, когда сравнили их с другой группой мышей, которые не получали антибиотики. Специалисты повышали дозировку препаратов, чтобы получить антибактериальный эффект у первой группы мышей.

Многие антибиотики вызывали процесс ускорения метаболизма в бактериях и его дестабилизацию со скоплением токсичных молекул. При этом антибактериальные препараты ухудшали степень защиты иммунных клеток с инфекцией.